运输系统管理与工程经济学科是上海市一流学科（Ｂ类）。

　　运输系统管理与工程经济学科方向综合应用自然科学和社会科学中的有关思想、理论和方法，紧密结合航运与物流行业特色，以管理科学、系统科学、信息科学、工程经济学为理论基础，注重定量分析与定性分析相结合，研究运输与物流系统决策、供应链管理、运输工程技术等领域中的前沿问题和热点问题。

　　近年来，主持国家级项目3项，省部级项目20余项；发表学术论文100余篇，其中被SCI、EI和ISTP收录近30篇，出版著作5部。获得上海市决策咨询研究成果二等奖2项、三等奖1项，上海市哲学社会科学优秀成果二等奖与三等奖各1项，获省市级教学研究成果奖2项。有1门课程被教育部列入2012年第一批精品视频公开课建设计划。

　　该学科方向依托上海市社会科学创新研究基地（“上海航运中心建设”方向）围绕国家航运事业发展和上海国际航运中心建设开展研究，已经递交上海市政府决策咨询研究报告12份，被上海市政府内参采纳成果专报12篇，其中受到上海市领导批示5篇次。承担中央与地方共建实验室项目，拥有航运管理决策实验室、港口物流系统优化实验室、航运经济与金融实验室等。